NetOGlyc 3.1d.ws0 Web Service Test
This is a test of the NetOGlyc - Prediction of o-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian proteins service.
Test filesDownload the files for this test
Test runRun test now
Support reference#1628-1687
Test of the NetOGlyc 3.1d.ws0 Web Service. The main script 'test_netoglyc.pl' requires the presence of the script 'xml-compile.pl' but no input data.
In case of problems please contact Edita Bartaseviciute, edita@cbs.dtu.dk or Kristoffer Rapacki, rapacki@cbs.dtu.dk
Show/hide recent test logs
view log 6 days agoPASSED
Test began: 2012-02-03 14:01:26 Test ended: 2012-02-03 14:01:54 Result : Test passed ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... # waiting for job f65d4ad7e360929eedb33bdf36f90ee4.... # job has finished Name: EGFR_HUMAN Length: 1210 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ------------------------------------------------------------------------ EGFR_HUMAN S 4 0.250 0.166 . - EGFR_HUMAN T 6 0.335 0.101 . - EGFR_HUMAN S 22 0.084 0.063 . - EGFR_HUMAN T 34 0.151 0.026 . - EGFR_HUMAN S 35 0.110 0.053 . - EGFR_HUMAN T 39 0.111 0.037 . - EGFR_HUMAN T 43 0.087 0.042 . - EGFR_HUMAN S 50 0.048 0.055 . - EGFR_HUMAN T 68 0.078 0.037 . - EGFR_HUMAN S 77 0.058 0.020 . - EGFR_HUMAN T 81 0.103 0.026 . - EGFR_HUMAN T 95 0.102 0.041 . - EGFR_HUMAN S 116 0.054 0.021 . - EGFR_HUMAN S 123 0.066 0.034 . - EGFR_HUMAN T 130 0.104 0.034 . - EGFR_HUMAN S 151 0.072 0.066 . - EGFR_HUMAN S 161 0.089 0.032 . - EGFR_HUMAN S 169 0.073 0.095 . - EGFR_HUMAN S 170 0.068 0.061 . - EGFR_HUMAN S 174 0.072 0.054 . - EGFR_HUMAN S 177 0.071 0.056 . - EGFR_HUMAN S 186 0.091 0.021 . - EGFR_HUMAN S 193 0.096 0.074 . - EGFR_HUMAN S 198 0.104 0.028 . - EGFR_HUMAN T 211 0.108 0.063 . - EGFR_HUMAN S 220 0.076 0.057 . - EGFR_HUMAN S 227 0.099 0.023 . - EGFR_HUMAN S 229 0.120 0.055 . - EGFR_HUMAN T 241 0.143 0.153 . - EGFR_HUMAN S 246 0.084 0.046 . - EGFR_HUMAN T 259 0.159 0.030 . - EGFR_HUMAN T 263 0.144 0.023 . - EGFR_HUMAN T 273 0.219 0.027 . - EGFR_HUMAN T 274 0.210 0.041 . - EGFR_HUMAN S 286 0.132 0.060 . - EGFR_HUMAN T 290 0.164 0.020 . - EGFR_HUMAN T 302 0.167 0.068 . - EGFR_HUMAN S 306 0.095 0.017 . - EGFR_HUMAN S 315 0.097 0.056 . - EGFR_HUMAN S 348 0.066 0.046 . - EGFR_HUMAN S 350 0.077 0.081 . - EGFR_HUMAN T 354 0.136 0.038 . - EGFR_HUMAN T 363 0.145 0.032 . - EGFR_HUMAN S 364 0.083 0.055 . - EGFR_HUMAN S 366 0.087 0.079 . - EGFR_HUMAN S 380 0.160 0.018 . - EGFR_HUMAN T 382 0.229 0.121 . - EGFR_HUMAN T 384 0.235 0.072 . - EGFR_HUMAN T 397 0.217 0.209 . - EGFR_HUMAN T 402 0.121 0.065 . - EGFR_HUMAN T 415 0.119 0.022 . - EGFR_HUMAN T 430 0.117 0.027 . - EGFR_HUMAN S 437 0.082 0.048 . - EGFR_HUMAN S 442 0.088 0.078 . - EGFR_HUMAN T 446 0.127 0.057 . - EGFR_HUMAN S 447 0.088 0.063 . - EGFR_HUMAN S 452 0.094 0.028 . - EGFR_HUMAN S 457 0.077 0.055 . - EGFR_HUMAN S 464 0.063 0.273 . - EGFR_HUMAN T 474 0.111 0.033 . - EGFR_HUMAN T 483 0.123 0.057 . - EGFR_HUMAN S 484 0.083 0.021 . - EGFR_HUMAN T 488 0.159 0.038 . - EGFR_HUMAN S 492 0.102 0.065 . - EGFR_HUMAN S 498 0.132 0.030 . - EGFR_HUMAN T 502 0.162 0.041 . - EGFR_HUMAN S 511 0.140 0.058 . - EGFR_HUMAN S 525 0.122 0.054 . - EGFR_HUMAN S 530 0.090 0.077 . - EGFR_HUMAN S 553 0.083 0.033 . - EGFR_HUMAN T 570 0.146 0.029 . - EGFR_HUMAN T 572 0.151 0.289 . - EGFR_HUMAN T 594 0.147 0.048 . - EGFR_HUMAN T 605 0.132 0.022 . - EGFR_HUMAN T 625 0.181 0.079 . - EGFR_HUMAN T 629 0.249 0.045 . - EGFR_HUMAN T 638 0.341 0.424 . - EGFR_HUMAN S 645 0.172 0.198 . - EGFR_HUMAN T 648 0.195 0.105 . - EGFR_HUMAN T 678 0.100 0.023 . - EGFR_HUMAN T 693 0.171 0.231 . - EGFR_HUMAN S 695 0.114 0.325 . - EGFR_HUMAN T 710 0.151 0.024 . - EGFR_HUMAN S 720 0.087 0.213 . - EGFR_HUMAN T 725 0.150 0.031 . - EGFR_HUMAN T 751 0.192 0.030 . - EGFR_HUMAN S 752 0.123 0.203 . - EGFR_HUMAN S 768 0.079 0.151 . - EGFR_HUMAN T 783 0.126 0.096 . - EGFR_HUMAN S 784 0.069 0.021 . - EGFR_HUMAN T 785 0.099 0.062 . - EGFR_HUMAN T 790 0.089 0.074 . - EGFR_HUMAN S 811 0.049 0.052 . - EGFR_HUMAN T 847 0.112 0.048 . - EGFR_HUMAN T 854 0.131 0.055 . - EGFR_HUMAN S 885 0.093 0.023 . - EGFR_HUMAN T 892 0.135 0.058 . - EGFR_HUMAN S 895 0.086 0.029 . - EGFR_HUMAN S 899 0.111 0.078 . - EGFR_HUMAN T 903 0.177 0.021 . - EGFR_HUMAN T 909 0.253 0.071 . - EGFR_HUMAN S 912 0.176 0.077 . - EGFR_HUMAN S 921 0.204 0.046 . - EGFR_HUMAN S 924 0.244 0.058 . - EGFR_HUMAN S 925 0.243 0.021 . - EGFR_HUMAN T 940 0.155 0.079 . - EGFR_HUMAN S 957 0.067 0.025 . - EGFR_HUMAN S 969 0.085 0.040 . - EGFR_HUMAN S 991 0.091 0.031 . - EGFR_HUMAN T 993 0.161 0.426 . - EGFR_HUMAN S 995 0.118 0.027 . - EGFR_HUMAN S 1025 0.240 0.056 . - EGFR_HUMAN S 1026 0.248 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1028 0.249 0.083 . - EGFR_HUMAN T 1029 0.332 0.202 . - EGFR_HUMAN S 1030 0.264 0.243 . - EGFR_HUMAN T 1032 0.436 0.049 . - EGFR_HUMAN S 1036 0.286 0.057 . - EGFR_HUMAN S 1037 0.282 0.104 . - EGFR_HUMAN S 1039 0.266 0.045 . - EGFR_HUMAN T 1041 0.333 0.053 . - EGFR_HUMAN S 1042 0.232 0.040 . - EGFR_HUMAN S 1045 0.184 0.017 . - EGFR_HUMAN T 1046 0.226 0.041 . - EGFR_HUMAN S 1057 0.102 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1064 0.135 0.018 . - EGFR_HUMAN S 1070 0.167 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1071 0.177 0.069 . - EGFR_HUMAN T 1074 0.295 0.123 . - EGFR_HUMAN T 1078 0.294 0.077 . - EGFR_HUMAN S 1081 0.187 0.020 . - EGFR_HUMAN T 1085 0.339 0.020 . - EGFR_HUMAN S 1096 0.229 0.033 . - EGFR_HUMAN S 1104 0.257 0.083 . - EGFR_HUMAN S 1120 0.255 0.370 . - EGFR_HUMAN S 1130 0.290 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1131 0.405 0.289 . - EGFR_HUMAN T 1141 0.360 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1145 0.305 0.048 . - EGFR_HUMAN S 1149 0.177 0.018 . - EGFR_HUMAN T 1150 0.258 0.071 . - EGFR_HUMAN S 1153 0.158 0.045 . - EGFR_HUMAN S 1162 0.132 0.034 . - EGFR_HUMAN S 1166 0.124 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1190 0.175 0.022 . - EGFR_HUMAN T 1191 0.272 0.030 . - EGFR_HUMAN S 1204 0.285 0.043 . - EGFR_HUMAN S 1205 0.306 0.066 . - -------------------------------------------------------------------------Download this log...
view log 2 weeks agoPASSED
Test began: 2012-01-29 18:52:13 Test ended: 2012-01-29 18:52:33 Result : Test passed ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... # waiting for job c7a805d671160ce887c7b5ba4b227091.... # job has finished Name: EGFR_HUMAN Length: 1210 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ------------------------------------------------------------------------ EGFR_HUMAN S 4 0.250 0.166 . - EGFR_HUMAN T 6 0.335 0.101 . - EGFR_HUMAN S 22 0.084 0.063 . - EGFR_HUMAN T 34 0.151 0.026 . - EGFR_HUMAN S 35 0.110 0.053 . - EGFR_HUMAN T 39 0.111 0.037 . - EGFR_HUMAN T 43 0.087 0.042 . - EGFR_HUMAN S 50 0.048 0.055 . - EGFR_HUMAN T 68 0.078 0.037 . - EGFR_HUMAN S 77 0.058 0.020 . - EGFR_HUMAN T 81 0.103 0.026 . - EGFR_HUMAN T 95 0.102 0.041 . - EGFR_HUMAN S 116 0.054 0.021 . - EGFR_HUMAN S 123 0.066 0.034 . - EGFR_HUMAN T 130 0.104 0.034 . - EGFR_HUMAN S 151 0.072 0.066 . - EGFR_HUMAN S 161 0.089 0.032 . - EGFR_HUMAN S 169 0.073 0.095 . - EGFR_HUMAN S 170 0.068 0.061 . - EGFR_HUMAN S 174 0.072 0.054 . - EGFR_HUMAN S 177 0.071 0.056 . - EGFR_HUMAN S 186 0.091 0.021 . - EGFR_HUMAN S 193 0.096 0.074 . - EGFR_HUMAN S 198 0.104 0.028 . - EGFR_HUMAN T 211 0.108 0.063 . - EGFR_HUMAN S 220 0.076 0.057 . - EGFR_HUMAN S 227 0.099 0.023 . - EGFR_HUMAN S 229 0.120 0.055 . - EGFR_HUMAN T 241 0.143 0.153 . - EGFR_HUMAN S 246 0.084 0.046 . - EGFR_HUMAN T 259 0.159 0.030 . - EGFR_HUMAN T 263 0.144 0.023 . - EGFR_HUMAN T 273 0.219 0.027 . - EGFR_HUMAN T 274 0.210 0.041 . - EGFR_HUMAN S 286 0.132 0.060 . - EGFR_HUMAN T 290 0.164 0.020 . - EGFR_HUMAN T 302 0.167 0.068 . - EGFR_HUMAN S 306 0.095 0.017 . - EGFR_HUMAN S 315 0.097 0.056 . - EGFR_HUMAN S 348 0.066 0.046 . - EGFR_HUMAN S 350 0.077 0.081 . - EGFR_HUMAN T 354 0.136 0.038 . - EGFR_HUMAN T 363 0.145 0.032 . - EGFR_HUMAN S 364 0.083 0.055 . - EGFR_HUMAN S 366 0.087 0.079 . - EGFR_HUMAN S 380 0.160 0.018 . - EGFR_HUMAN T 382 0.229 0.121 . - EGFR_HUMAN T 384 0.235 0.072 . - EGFR_HUMAN T 397 0.217 0.209 . - EGFR_HUMAN T 402 0.121 0.065 . - EGFR_HUMAN T 415 0.119 0.022 . - EGFR_HUMAN T 430 0.117 0.027 . - EGFR_HUMAN S 437 0.082 0.048 . - EGFR_HUMAN S 442 0.088 0.078 . - EGFR_HUMAN T 446 0.127 0.057 . - EGFR_HUMAN S 447 0.088 0.063 . - EGFR_HUMAN S 452 0.094 0.028 . - EGFR_HUMAN S 457 0.077 0.055 . - EGFR_HUMAN S 464 0.063 0.273 . - EGFR_HUMAN T 474 0.111 0.033 . - EGFR_HUMAN T 483 0.123 0.057 . - EGFR_HUMAN S 484 0.083 0.021 . - EGFR_HUMAN T 488 0.159 0.038 . - EGFR_HUMAN S 492 0.102 0.065 . - EGFR_HUMAN S 498 0.132 0.030 . - EGFR_HUMAN T 502 0.162 0.041 . - EGFR_HUMAN S 511 0.140 0.058 . - EGFR_HUMAN S 525 0.122 0.054 . - EGFR_HUMAN S 530 0.090 0.077 . - EGFR_HUMAN S 553 0.083 0.033 . - EGFR_HUMAN T 570 0.146 0.029 . - EGFR_HUMAN T 572 0.151 0.289 . - EGFR_HUMAN T 594 0.147 0.048 . - EGFR_HUMAN T 605 0.132 0.022 . - EGFR_HUMAN T 625 0.181 0.079 . - EGFR_HUMAN T 629 0.249 0.045 . - EGFR_HUMAN T 638 0.341 0.424 . - EGFR_HUMAN S 645 0.172 0.198 . - EGFR_HUMAN T 648 0.195 0.105 . - EGFR_HUMAN T 678 0.100 0.023 . - EGFR_HUMAN T 693 0.171 0.231 . - EGFR_HUMAN S 695 0.114 0.325 . - EGFR_HUMAN T 710 0.151 0.024 . - EGFR_HUMAN S 720 0.087 0.213 . - EGFR_HUMAN T 725 0.150 0.031 . - EGFR_HUMAN T 751 0.192 0.030 . - EGFR_HUMAN S 752 0.123 0.203 . - EGFR_HUMAN S 768 0.079 0.151 . - EGFR_HUMAN T 783 0.126 0.096 . - EGFR_HUMAN S 784 0.069 0.021 . - EGFR_HUMAN T 785 0.099 0.062 . - EGFR_HUMAN T 790 0.089 0.074 . - EGFR_HUMAN S 811 0.049 0.052 . - EGFR_HUMAN T 847 0.112 0.048 . - EGFR_HUMAN T 854 0.131 0.055 . - EGFR_HUMAN S 885 0.093 0.023 . - EGFR_HUMAN T 892 0.135 0.058 . - EGFR_HUMAN S 895 0.086 0.029 . - EGFR_HUMAN S 899 0.111 0.078 . - EGFR_HUMAN T 903 0.177 0.021 . - EGFR_HUMAN T 909 0.253 0.071 . - EGFR_HUMAN S 912 0.176 0.077 . - EGFR_HUMAN S 921 0.204 0.046 . - EGFR_HUMAN S 924 0.244 0.058 . - EGFR_HUMAN S 925 0.243 0.021 . - EGFR_HUMAN T 940 0.155 0.079 . - EGFR_HUMAN S 957 0.067 0.025 . - EGFR_HUMAN S 969 0.085 0.040 . - EGFR_HUMAN S 991 0.091 0.031 . - EGFR_HUMAN T 993 0.161 0.426 . - EGFR_HUMAN S 995 0.118 0.027 . - EGFR_HUMAN S 1025 0.240 0.056 . - EGFR_HUMAN S 1026 0.248 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1028 0.249 0.083 . - EGFR_HUMAN T 1029 0.332 0.202 . - EGFR_HUMAN S 1030 0.264 0.243 . - EGFR_HUMAN T 1032 0.436 0.049 . - EGFR_HUMAN S 1036 0.286 0.057 . - EGFR_HUMAN S 1037 0.282 0.104 . - EGFR_HUMAN S 1039 0.266 0.045 . - EGFR_HUMAN T 1041 0.333 0.053 . - EGFR_HUMAN S 1042 0.232 0.040 . - EGFR_HUMAN S 1045 0.184 0.017 . - EGFR_HUMAN T 1046 0.226 0.041 . - EGFR_HUMAN S 1057 0.102 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1064 0.135 0.018 . - EGFR_HUMAN S 1070 0.167 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1071 0.177 0.069 . - EGFR_HUMAN T 1074 0.295 0.123 . - EGFR_HUMAN T 1078 0.294 0.077 . - EGFR_HUMAN S 1081 0.187 0.020 . - EGFR_HUMAN T 1085 0.339 0.020 . - EGFR_HUMAN S 1096 0.229 0.033 . - EGFR_HUMAN S 1104 0.257 0.083 . - EGFR_HUMAN S 1120 0.255 0.370 . - EGFR_HUMAN S 1130 0.290 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1131 0.405 0.289 . - EGFR_HUMAN T 1141 0.360 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1145 0.305 0.048 . - EGFR_HUMAN S 1149 0.177 0.018 . - EGFR_HUMAN T 1150 0.258 0.071 . - EGFR_HUMAN S 1153 0.158 0.045 . - EGFR_HUMAN S 1162 0.132 0.034 . - EGFR_HUMAN S 1166 0.124 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1190 0.175 0.022 . - EGFR_HUMAN T 1191 0.272 0.030 . - EGFR_HUMAN S 1204 0.285 0.043 . - EGFR_HUMAN S 1205 0.306 0.066 . - -------------------------------------------------------------------------Download this log...
view log 2 weeks agoPASSED
Test began: 2012-01-25 13:44:48 Test ended: 2012-01-25 13:45:11 Result : Test passed ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... # waiting for job 13c3c709c448a29714e68356146e3fe8.... # job has finished Name: EGFR_HUMAN Length: 1210 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ------------------------------------------------------------------------ EGFR_HUMAN S 4 0.250 0.166 . - EGFR_HUMAN T 6 0.335 0.101 . - EGFR_HUMAN S 22 0.084 0.063 . - EGFR_HUMAN T 34 0.151 0.026 . - EGFR_HUMAN S 35 0.110 0.053 . - EGFR_HUMAN T 39 0.111 0.037 . - EGFR_HUMAN T 43 0.087 0.042 . - EGFR_HUMAN S 50 0.048 0.055 . - EGFR_HUMAN T 68 0.078 0.037 . - EGFR_HUMAN S 77 0.058 0.020 . - EGFR_HUMAN T 81 0.103 0.026 . - EGFR_HUMAN T 95 0.102 0.041 . - EGFR_HUMAN S 116 0.054 0.021 . - EGFR_HUMAN S 123 0.066 0.034 . - EGFR_HUMAN T 130 0.104 0.034 . - EGFR_HUMAN S 151 0.072 0.066 . - EGFR_HUMAN S 161 0.089 0.032 . - EGFR_HUMAN S 169 0.073 0.095 . - EGFR_HUMAN S 170 0.068 0.061 . - EGFR_HUMAN S 174 0.072 0.054 . - EGFR_HUMAN S 177 0.071 0.056 . - EGFR_HUMAN S 186 0.091 0.021 . - EGFR_HUMAN S 193 0.096 0.074 . - EGFR_HUMAN S 198 0.104 0.028 . - EGFR_HUMAN T 211 0.108 0.063 . - EGFR_HUMAN S 220 0.076 0.057 . - EGFR_HUMAN S 227 0.099 0.023 . - EGFR_HUMAN S 229 0.120 0.055 . - EGFR_HUMAN T 241 0.143 0.153 . - EGFR_HUMAN S 246 0.084 0.046 . - EGFR_HUMAN T 259 0.159 0.030 . - EGFR_HUMAN T 263 0.144 0.023 . - EGFR_HUMAN T 273 0.219 0.027 . - EGFR_HUMAN T 274 0.210 0.041 . - EGFR_HUMAN S 286 0.132 0.060 . - EGFR_HUMAN T 290 0.164 0.020 . - EGFR_HUMAN T 302 0.167 0.068 . - EGFR_HUMAN S 306 0.095 0.017 . - EGFR_HUMAN S 315 0.097 0.056 . - EGFR_HUMAN S 348 0.066 0.046 . - EGFR_HUMAN S 350 0.077 0.081 . - EGFR_HUMAN T 354 0.136 0.038 . - EGFR_HUMAN T 363 0.145 0.032 . - EGFR_HUMAN S 364 0.083 0.055 . - EGFR_HUMAN S 366 0.087 0.079 . - EGFR_HUMAN S 380 0.160 0.018 . - EGFR_HUMAN T 382 0.229 0.121 . - EGFR_HUMAN T 384 0.235 0.072 . - EGFR_HUMAN T 397 0.217 0.209 . - EGFR_HUMAN T 402 0.121 0.065 . - EGFR_HUMAN T 415 0.119 0.022 . - EGFR_HUMAN T 430 0.117 0.027 . - EGFR_HUMAN S 437 0.082 0.048 . - EGFR_HUMAN S 442 0.088 0.078 . - EGFR_HUMAN T 446 0.127 0.057 . - EGFR_HUMAN S 447 0.088 0.063 . - EGFR_HUMAN S 452 0.094 0.028 . - EGFR_HUMAN S 457 0.077 0.055 . - EGFR_HUMAN S 464 0.063 0.273 . - EGFR_HUMAN T 474 0.111 0.033 . - EGFR_HUMAN T 483 0.123 0.057 . - EGFR_HUMAN S 484 0.083 0.021 . - EGFR_HUMAN T 488 0.159 0.038 . - EGFR_HUMAN S 492 0.102 0.065 . - EGFR_HUMAN S 498 0.132 0.030 . - EGFR_HUMAN T 502 0.162 0.041 . - EGFR_HUMAN S 511 0.140 0.058 . - EGFR_HUMAN S 525 0.122 0.054 . - EGFR_HUMAN S 530 0.090 0.077 . - EGFR_HUMAN S 553 0.083 0.033 . - EGFR_HUMAN T 570 0.146 0.029 . - EGFR_HUMAN T 572 0.151 0.289 . - EGFR_HUMAN T 594 0.147 0.048 . - EGFR_HUMAN T 605 0.132 0.022 . - EGFR_HUMAN T 625 0.181 0.079 . - EGFR_HUMAN T 629 0.249 0.045 . - EGFR_HUMAN T 638 0.341 0.424 . - EGFR_HUMAN S 645 0.172 0.198 . - EGFR_HUMAN T 648 0.195 0.105 . - EGFR_HUMAN T 678 0.100 0.023 . - EGFR_HUMAN T 693 0.171 0.231 . - EGFR_HUMAN S 695 0.114 0.325 . - EGFR_HUMAN T 710 0.151 0.024 . - EGFR_HUMAN S 720 0.087 0.213 . - EGFR_HUMAN T 725 0.150 0.031 . - EGFR_HUMAN T 751 0.192 0.030 . - EGFR_HUMAN S 752 0.123 0.203 . - EGFR_HUMAN S 768 0.079 0.151 . - EGFR_HUMAN T 783 0.126 0.096 . - EGFR_HUMAN S 784 0.069 0.021 . - EGFR_HUMAN T 785 0.099 0.062 . - EGFR_HUMAN T 790 0.089 0.074 . - EGFR_HUMAN S 811 0.049 0.052 . - EGFR_HUMAN T 847 0.112 0.048 . - EGFR_HUMAN T 854 0.131 0.055 . - EGFR_HUMAN S 885 0.093 0.023 . - EGFR_HUMAN T 892 0.135 0.058 . - EGFR_HUMAN S 895 0.086 0.029 . - EGFR_HUMAN S 899 0.111 0.078 . - EGFR_HUMAN T 903 0.177 0.021 . - EGFR_HUMAN T 909 0.253 0.071 . - EGFR_HUMAN S 912 0.176 0.077 . - EGFR_HUMAN S 921 0.204 0.046 . - EGFR_HUMAN S 924 0.244 0.058 . - EGFR_HUMAN S 925 0.243 0.021 . - EGFR_HUMAN T 940 0.155 0.079 . - EGFR_HUMAN S 957 0.067 0.025 . - EGFR_HUMAN S 969 0.085 0.040 . - EGFR_HUMAN S 991 0.091 0.031 . - EGFR_HUMAN T 993 0.161 0.426 . - EGFR_HUMAN S 995 0.118 0.027 . - EGFR_HUMAN S 1025 0.240 0.056 . - EGFR_HUMAN S 1026 0.248 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1028 0.249 0.083 . - EGFR_HUMAN T 1029 0.332 0.202 . - EGFR_HUMAN S 1030 0.264 0.243 . - EGFR_HUMAN T 1032 0.436 0.049 . - EGFR_HUMAN S 1036 0.286 0.057 . - EGFR_HUMAN S 1037 0.282 0.104 . - EGFR_HUMAN S 1039 0.266 0.045 . - EGFR_HUMAN T 1041 0.333 0.053 . - EGFR_HUMAN S 1042 0.232 0.040 . - EGFR_HUMAN S 1045 0.184 0.017 . - EGFR_HUMAN T 1046 0.226 0.041 . - EGFR_HUMAN S 1057 0.102 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1064 0.135 0.018 . - EGFR_HUMAN S 1070 0.167 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1071 0.177 0.069 . - EGFR_HUMAN T 1074 0.295 0.123 . - EGFR_HUMAN T 1078 0.294 0.077 . - EGFR_HUMAN S 1081 0.187 0.020 . - EGFR_HUMAN T 1085 0.339 0.020 . - EGFR_HUMAN S 1096 0.229 0.033 . - EGFR_HUMAN S 1104 0.257 0.083 . - EGFR_HUMAN S 1120 0.255 0.370 . - EGFR_HUMAN S 1130 0.290 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1131 0.405 0.289 . - EGFR_HUMAN T 1141 0.360 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1145 0.305 0.048 . - EGFR_HUMAN S 1149 0.177 0.018 . - EGFR_HUMAN T 1150 0.258 0.071 . - EGFR_HUMAN S 1153 0.158 0.045 . - EGFR_HUMAN S 1162 0.132 0.034 . - EGFR_HUMAN S 1166 0.124 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1190 0.175 0.022 . - EGFR_HUMAN T 1191 0.272 0.030 . - EGFR_HUMAN S 1204 0.285 0.043 . - EGFR_HUMAN S 1205 0.306 0.066 . - -------------------------------------------------------------------------Download this log...
view log 1 month agoPASSED
Test began: 2012-01-07 13:23:31 Test ended: 2012-01-07 13:23:52 Result : Test passed ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... # waiting for job 2e07c20e663c30d6d6f13dd4027e7654.... # job has finished Name: EGFR_HUMAN Length: 1210 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ------------------------------------------------------------------------ EGFR_HUMAN S 4 0.250 0.166 . - EGFR_HUMAN T 6 0.335 0.101 . - EGFR_HUMAN S 22 0.084 0.063 . - EGFR_HUMAN T 34 0.151 0.026 . - EGFR_HUMAN S 35 0.110 0.053 . - EGFR_HUMAN T 39 0.111 0.037 . - EGFR_HUMAN T 43 0.087 0.042 . - EGFR_HUMAN S 50 0.048 0.055 . - EGFR_HUMAN T 68 0.078 0.037 . - EGFR_HUMAN S 77 0.058 0.020 . - EGFR_HUMAN T 81 0.103 0.026 . - EGFR_HUMAN T 95 0.102 0.041 . - EGFR_HUMAN S 116 0.054 0.021 . - EGFR_HUMAN S 123 0.066 0.034 . - EGFR_HUMAN T 130 0.104 0.034 . - EGFR_HUMAN S 151 0.072 0.066 . - EGFR_HUMAN S 161 0.089 0.032 . - EGFR_HUMAN S 169 0.073 0.095 . - EGFR_HUMAN S 170 0.068 0.061 . - EGFR_HUMAN S 174 0.072 0.054 . - EGFR_HUMAN S 177 0.071 0.056 . - EGFR_HUMAN S 186 0.091 0.021 . - EGFR_HUMAN S 193 0.096 0.074 . - EGFR_HUMAN S 198 0.104 0.028 . - EGFR_HUMAN T 211 0.108 0.063 . - EGFR_HUMAN S 220 0.076 0.057 . - EGFR_HUMAN S 227 0.099 0.023 . - EGFR_HUMAN S 229 0.120 0.055 . - EGFR_HUMAN T 241 0.143 0.153 . - EGFR_HUMAN S 246 0.084 0.046 . - EGFR_HUMAN T 259 0.159 0.030 . - EGFR_HUMAN T 263 0.144 0.023 . - EGFR_HUMAN T 273 0.219 0.027 . - EGFR_HUMAN T 274 0.210 0.041 . - EGFR_HUMAN S 286 0.132 0.060 . - EGFR_HUMAN T 290 0.164 0.020 . - EGFR_HUMAN T 302 0.167 0.068 . - EGFR_HUMAN S 306 0.095 0.017 . - EGFR_HUMAN S 315 0.097 0.056 . - EGFR_HUMAN S 348 0.066 0.046 . - EGFR_HUMAN S 350 0.077 0.081 . - EGFR_HUMAN T 354 0.136 0.038 . - EGFR_HUMAN T 363 0.145 0.032 . - EGFR_HUMAN S 364 0.083 0.055 . - EGFR_HUMAN S 366 0.087 0.079 . - EGFR_HUMAN S 380 0.160 0.018 . - EGFR_HUMAN T 382 0.229 0.121 . - EGFR_HUMAN T 384 0.235 0.072 . - EGFR_HUMAN T 397 0.217 0.209 . - EGFR_HUMAN T 402 0.121 0.065 . - EGFR_HUMAN T 415 0.119 0.022 . - EGFR_HUMAN T 430 0.117 0.027 . - EGFR_HUMAN S 437 0.082 0.048 . - EGFR_HUMAN S 442 0.088 0.078 . - EGFR_HUMAN T 446 0.127 0.057 . - EGFR_HUMAN S 447 0.088 0.063 . - EGFR_HUMAN S 452 0.094 0.028 . - EGFR_HUMAN S 457 0.077 0.055 . - EGFR_HUMAN S 464 0.063 0.273 . - EGFR_HUMAN T 474 0.111 0.033 . - EGFR_HUMAN T 483 0.123 0.057 . - EGFR_HUMAN S 484 0.083 0.021 . - EGFR_HUMAN T 488 0.159 0.038 . - EGFR_HUMAN S 492 0.102 0.065 . - EGFR_HUMAN S 498 0.132 0.030 . - EGFR_HUMAN T 502 0.162 0.041 . - EGFR_HUMAN S 511 0.140 0.058 . - EGFR_HUMAN S 525 0.122 0.054 . - EGFR_HUMAN S 530 0.090 0.077 . - EGFR_HUMAN S 553 0.083 0.033 . - EGFR_HUMAN T 570 0.146 0.029 . - EGFR_HUMAN T 572 0.151 0.289 . - EGFR_HUMAN T 594 0.147 0.048 . - EGFR_HUMAN T 605 0.132 0.022 . - EGFR_HUMAN T 625 0.181 0.079 . - EGFR_HUMAN T 629 0.249 0.045 . - EGFR_HUMAN T 638 0.341 0.424 . - EGFR_HUMAN S 645 0.172 0.198 . - EGFR_HUMAN T 648 0.195 0.105 . - EGFR_HUMAN T 678 0.100 0.023 . - EGFR_HUMAN T 693 0.171 0.231 . - EGFR_HUMAN S 695 0.114 0.325 . - EGFR_HUMAN T 710 0.151 0.024 . - EGFR_HUMAN S 720 0.087 0.213 . - EGFR_HUMAN T 725 0.150 0.031 . - EGFR_HUMAN T 751 0.192 0.030 . - EGFR_HUMAN S 752 0.123 0.203 . - EGFR_HUMAN S 768 0.079 0.151 . - EGFR_HUMAN T 783 0.126 0.096 . - EGFR_HUMAN S 784 0.069 0.021 . - EGFR_HUMAN T 785 0.099 0.062 . - EGFR_HUMAN T 790 0.089 0.074 . - EGFR_HUMAN S 811 0.049 0.052 . - EGFR_HUMAN T 847 0.112 0.048 . - EGFR_HUMAN T 854 0.131 0.055 . - EGFR_HUMAN S 885 0.093 0.023 . - EGFR_HUMAN T 892 0.135 0.058 . - EGFR_HUMAN S 895 0.086 0.029 . - EGFR_HUMAN S 899 0.111 0.078 . - EGFR_HUMAN T 903 0.177 0.021 . - EGFR_HUMAN T 909 0.253 0.071 . - EGFR_HUMAN S 912 0.176 0.077 . - EGFR_HUMAN S 921 0.204 0.046 . - EGFR_HUMAN S 924 0.244 0.058 . - EGFR_HUMAN S 925 0.243 0.021 . - EGFR_HUMAN T 940 0.155 0.079 . - EGFR_HUMAN S 957 0.067 0.025 . - EGFR_HUMAN S 969 0.085 0.040 . - EGFR_HUMAN S 991 0.091 0.031 . - EGFR_HUMAN T 993 0.161 0.426 . - EGFR_HUMAN S 995 0.118 0.027 . - EGFR_HUMAN S 1025 0.240 0.056 . - EGFR_HUMAN S 1026 0.248 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1028 0.249 0.083 . - EGFR_HUMAN T 1029 0.332 0.202 . - EGFR_HUMAN S 1030 0.264 0.243 . - EGFR_HUMAN T 1032 0.436 0.049 . - EGFR_HUMAN S 1036 0.286 0.057 . - EGFR_HUMAN S 1037 0.282 0.104 . - EGFR_HUMAN S 1039 0.266 0.045 . - EGFR_HUMAN T 1041 0.333 0.053 . - EGFR_HUMAN S 1042 0.232 0.040 . - EGFR_HUMAN S 1045 0.184 0.017 . - EGFR_HUMAN T 1046 0.226 0.041 . - EGFR_HUMAN S 1057 0.102 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1064 0.135 0.018 . - EGFR_HUMAN S 1070 0.167 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1071 0.177 0.069 . - EGFR_HUMAN T 1074 0.295 0.123 . - EGFR_HUMAN T 1078 0.294 0.077 . - EGFR_HUMAN S 1081 0.187 0.020 . - EGFR_HUMAN T 1085 0.339 0.020 . - EGFR_HUMAN S 1096 0.229 0.033 . - EGFR_HUMAN S 1104 0.257 0.083 . - EGFR_HUMAN S 1120 0.255 0.370 . - EGFR_HUMAN S 1130 0.290 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1131 0.405 0.289 . - EGFR_HUMAN T 1141 0.360 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1145 0.305 0.048 . - EGFR_HUMAN S 1149 0.177 0.018 . - EGFR_HUMAN T 1150 0.258 0.071 . - EGFR_HUMAN S 1153 0.158 0.045 . - EGFR_HUMAN S 1162 0.132 0.034 . - EGFR_HUMAN S 1166 0.124 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1190 0.175 0.022 . - EGFR_HUMAN T 1191 0.272 0.030 . - EGFR_HUMAN S 1204 0.285 0.043 . - EGFR_HUMAN S 1205 0.306 0.066 . - -------------------------------------------------------------------------Download this log...
view log 1 month agoPASSED
Test began: 2012-01-03 12:40:33 Test ended: 2012-01-03 12:41:02 Result : Test passed ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... # waiting for job ad85e4430c5fc581789dd31e08a11085.... # job has finished Name: EGFR_HUMAN Length: 1210 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ------------------------------------------------------------------------ EGFR_HUMAN S 4 0.250 0.166 . - EGFR_HUMAN T 6 0.335 0.101 . - EGFR_HUMAN S 22 0.084 0.063 . - EGFR_HUMAN T 34 0.151 0.026 . - EGFR_HUMAN S 35 0.110 0.053 . - EGFR_HUMAN T 39 0.111 0.037 . - EGFR_HUMAN T 43 0.087 0.042 . - EGFR_HUMAN S 50 0.048 0.055 . - EGFR_HUMAN T 68 0.078 0.037 . - EGFR_HUMAN S 77 0.058 0.020 . - EGFR_HUMAN T 81 0.103 0.026 . - EGFR_HUMAN T 95 0.102 0.041 . - EGFR_HUMAN S 116 0.054 0.021 . - EGFR_HUMAN S 123 0.066 0.034 . - EGFR_HUMAN T 130 0.104 0.034 . - EGFR_HUMAN S 151 0.072 0.066 . - EGFR_HUMAN S 161 0.089 0.032 . - EGFR_HUMAN S 169 0.073 0.095 . - EGFR_HUMAN S 170 0.068 0.061 . - EGFR_HUMAN S 174 0.072 0.054 . - EGFR_HUMAN S 177 0.071 0.056 . - EGFR_HUMAN S 186 0.091 0.021 . - EGFR_HUMAN S 193 0.096 0.074 . - EGFR_HUMAN S 198 0.104 0.028 . - EGFR_HUMAN T 211 0.108 0.063 . - EGFR_HUMAN S 220 0.076 0.057 . - EGFR_HUMAN S 227 0.099 0.023 . - EGFR_HUMAN S 229 0.120 0.055 . - EGFR_HUMAN T 241 0.143 0.153 . - EGFR_HUMAN S 246 0.084 0.046 . - EGFR_HUMAN T 259 0.159 0.030 . - EGFR_HUMAN T 263 0.144 0.023 . - EGFR_HUMAN T 273 0.219 0.027 . - EGFR_HUMAN T 274 0.210 0.041 . - EGFR_HUMAN S 286 0.132 0.060 . - EGFR_HUMAN T 290 0.164 0.020 . - EGFR_HUMAN T 302 0.167 0.068 . - EGFR_HUMAN S 306 0.095 0.017 . - EGFR_HUMAN S 315 0.097 0.056 . - EGFR_HUMAN S 348 0.066 0.046 . - EGFR_HUMAN S 350 0.077 0.081 . - EGFR_HUMAN T 354 0.136 0.038 . - EGFR_HUMAN T 363 0.145 0.032 . - EGFR_HUMAN S 364 0.083 0.055 . - EGFR_HUMAN S 366 0.087 0.079 . - EGFR_HUMAN S 380 0.160 0.018 . - EGFR_HUMAN T 382 0.229 0.121 . - EGFR_HUMAN T 384 0.235 0.072 . - EGFR_HUMAN T 397 0.217 0.209 . - EGFR_HUMAN T 402 0.121 0.065 . - EGFR_HUMAN T 415 0.119 0.022 . - EGFR_HUMAN T 430 0.117 0.027 . - EGFR_HUMAN S 437 0.082 0.048 . - EGFR_HUMAN S 442 0.088 0.078 . - EGFR_HUMAN T 446 0.127 0.057 . - EGFR_HUMAN S 447 0.088 0.063 . - EGFR_HUMAN S 452 0.094 0.028 . - EGFR_HUMAN S 457 0.077 0.055 . - EGFR_HUMAN S 464 0.063 0.273 . - EGFR_HUMAN T 474 0.111 0.033 . - EGFR_HUMAN T 483 0.123 0.057 . - EGFR_HUMAN S 484 0.083 0.021 . - EGFR_HUMAN T 488 0.159 0.038 . - EGFR_HUMAN S 492 0.102 0.065 . - EGFR_HUMAN S 498 0.132 0.030 . - EGFR_HUMAN T 502 0.162 0.041 . - EGFR_HUMAN S 511 0.140 0.058 . - EGFR_HUMAN S 525 0.122 0.054 . - EGFR_HUMAN S 530 0.090 0.077 . - EGFR_HUMAN S 553 0.083 0.033 . - EGFR_HUMAN T 570 0.146 0.029 . - EGFR_HUMAN T 572 0.151 0.289 . - EGFR_HUMAN T 594 0.147 0.048 . - EGFR_HUMAN T 605 0.132 0.022 . - EGFR_HUMAN T 625 0.181 0.079 . - EGFR_HUMAN T 629 0.249 0.045 . - EGFR_HUMAN T 638 0.341 0.424 . - EGFR_HUMAN S 645 0.172 0.198 . - EGFR_HUMAN T 648 0.195 0.105 . - EGFR_HUMAN T 678 0.100 0.023 . - EGFR_HUMAN T 693 0.171 0.231 . - EGFR_HUMAN S 695 0.114 0.325 . - EGFR_HUMAN T 710 0.151 0.024 . - EGFR_HUMAN S 720 0.087 0.213 . - EGFR_HUMAN T 725 0.150 0.031 . - EGFR_HUMAN T 751 0.192 0.030 . - EGFR_HUMAN S 752 0.123 0.203 . - EGFR_HUMAN S 768 0.079 0.151 . - EGFR_HUMAN T 783 0.126 0.096 . - EGFR_HUMAN S 784 0.069 0.021 . - EGFR_HUMAN T 785 0.099 0.062 . - EGFR_HUMAN T 790 0.089 0.074 . - EGFR_HUMAN S 811 0.049 0.052 . - EGFR_HUMAN T 847 0.112 0.048 . - EGFR_HUMAN T 854 0.131 0.055 . - EGFR_HUMAN S 885 0.093 0.023 . - EGFR_HUMAN T 892 0.135 0.058 . - EGFR_HUMAN S 895 0.086 0.029 . - EGFR_HUMAN S 899 0.111 0.078 . - EGFR_HUMAN T 903 0.177 0.021 . - EGFR_HUMAN T 909 0.253 0.071 . - EGFR_HUMAN S 912 0.176 0.077 . - EGFR_HUMAN S 921 0.204 0.046 . - EGFR_HUMAN S 924 0.244 0.058 . - EGFR_HUMAN S 925 0.243 0.021 . - EGFR_HUMAN T 940 0.155 0.079 . - EGFR_HUMAN S 957 0.067 0.025 . - EGFR_HUMAN S 969 0.085 0.040 . - EGFR_HUMAN S 991 0.091 0.031 . - EGFR_HUMAN T 993 0.161 0.426 . - EGFR_HUMAN S 995 0.118 0.027 . - EGFR_HUMAN S 1025 0.240 0.056 . - EGFR_HUMAN S 1026 0.248 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1028 0.249 0.083 . - EGFR_HUMAN T 1029 0.332 0.202 . - EGFR_HUMAN S 1030 0.264 0.243 . - EGFR_HUMAN T 1032 0.436 0.049 . - EGFR_HUMAN S 1036 0.286 0.057 . - EGFR_HUMAN S 1037 0.282 0.104 . - EGFR_HUMAN S 1039 0.266 0.045 . - EGFR_HUMAN T 1041 0.333 0.053 . - EGFR_HUMAN S 1042 0.232 0.040 . - EGFR_HUMAN S 1045 0.184 0.017 . - EGFR_HUMAN T 1046 0.226 0.041 . - EGFR_HUMAN S 1057 0.102 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1064 0.135 0.018 . - EGFR_HUMAN S 1070 0.167 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1071 0.177 0.069 . - EGFR_HUMAN T 1074 0.295 0.123 . - EGFR_HUMAN T 1078 0.294 0.077 . - EGFR_HUMAN S 1081 0.187 0.020 . - EGFR_HUMAN T 1085 0.339 0.020 . - EGFR_HUMAN S 1096 0.229 0.033 . - EGFR_HUMAN S 1104 0.257 0.083 . - EGFR_HUMAN S 1120 0.255 0.370 . - EGFR_HUMAN S 1130 0.290 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1131 0.405 0.289 . - EGFR_HUMAN T 1141 0.360 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1145 0.305 0.048 . - EGFR_HUMAN S 1149 0.177 0.018 . - EGFR_HUMAN T 1150 0.258 0.071 . - EGFR_HUMAN S 1153 0.158 0.045 . - EGFR_HUMAN S 1162 0.132 0.034 . - EGFR_HUMAN S 1166 0.124 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1190 0.175 0.022 . - EGFR_HUMAN T 1191 0.272 0.030 . - EGFR_HUMAN S 1204 0.285 0.043 . - EGFR_HUMAN S 1205 0.306 0.066 . - -------------------------------------------------------------------------Download this log...
view log 1 month agoPASSED
Test began: 2012-01-02 14:29:57 Test ended: 2012-01-02 14:30:19 Result : Test passed ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... # waiting for job 819d8f87233e1fa54aa6a6dea2cb743b.... # job has finished Name: EGFR_HUMAN Length: 1210 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ------------------------------------------------------------------------ EGFR_HUMAN S 4 0.250 0.166 . - EGFR_HUMAN T 6 0.335 0.101 . - EGFR_HUMAN S 22 0.084 0.063 . - EGFR_HUMAN T 34 0.151 0.026 . - EGFR_HUMAN S 35 0.110 0.053 . - EGFR_HUMAN T 39 0.111 0.037 . - EGFR_HUMAN T 43 0.087 0.042 . - EGFR_HUMAN S 50 0.048 0.055 . - EGFR_HUMAN T 68 0.078 0.037 . - EGFR_HUMAN S 77 0.058 0.020 . - EGFR_HUMAN T 81 0.103 0.026 . - EGFR_HUMAN T 95 0.102 0.041 . - EGFR_HUMAN S 116 0.054 0.021 . - EGFR_HUMAN S 123 0.066 0.034 . - EGFR_HUMAN T 130 0.104 0.034 . - EGFR_HUMAN S 151 0.072 0.066 . - EGFR_HUMAN S 161 0.089 0.032 . - EGFR_HUMAN S 169 0.073 0.095 . - EGFR_HUMAN S 170 0.068 0.061 . - EGFR_HUMAN S 174 0.072 0.054 . - EGFR_HUMAN S 177 0.071 0.056 . - EGFR_HUMAN S 186 0.091 0.021 . - EGFR_HUMAN S 193 0.096 0.074 . - EGFR_HUMAN S 198 0.104 0.028 . - EGFR_HUMAN T 211 0.108 0.063 . - EGFR_HUMAN S 220 0.076 0.057 . - EGFR_HUMAN S 227 0.099 0.023 . - EGFR_HUMAN S 229 0.120 0.055 . - EGFR_HUMAN T 241 0.143 0.153 . - EGFR_HUMAN S 246 0.084 0.046 . - EGFR_HUMAN T 259 0.159 0.030 . - EGFR_HUMAN T 263 0.144 0.023 . - EGFR_HUMAN T 273 0.219 0.027 . - EGFR_HUMAN T 274 0.210 0.041 . - EGFR_HUMAN S 286 0.132 0.060 . - EGFR_HUMAN T 290 0.164 0.020 . - EGFR_HUMAN T 302 0.167 0.068 . - EGFR_HUMAN S 306 0.095 0.017 . - EGFR_HUMAN S 315 0.097 0.056 . - EGFR_HUMAN S 348 0.066 0.046 . - EGFR_HUMAN S 350 0.077 0.081 . - EGFR_HUMAN T 354 0.136 0.038 . - EGFR_HUMAN T 363 0.145 0.032 . - EGFR_HUMAN S 364 0.083 0.055 . - EGFR_HUMAN S 366 0.087 0.079 . - EGFR_HUMAN S 380 0.160 0.018 . - EGFR_HUMAN T 382 0.229 0.121 . - EGFR_HUMAN T 384 0.235 0.072 . - EGFR_HUMAN T 397 0.217 0.209 . - EGFR_HUMAN T 402 0.121 0.065 . - EGFR_HUMAN T 415 0.119 0.022 . - EGFR_HUMAN T 430 0.117 0.027 . - EGFR_HUMAN S 437 0.082 0.048 . - EGFR_HUMAN S 442 0.088 0.078 . - EGFR_HUMAN T 446 0.127 0.057 . - EGFR_HUMAN S 447 0.088 0.063 . - EGFR_HUMAN S 452 0.094 0.028 . - EGFR_HUMAN S 457 0.077 0.055 . - EGFR_HUMAN S 464 0.063 0.273 . - EGFR_HUMAN T 474 0.111 0.033 . - EGFR_HUMAN T 483 0.123 0.057 . - EGFR_HUMAN S 484 0.083 0.021 . - EGFR_HUMAN T 488 0.159 0.038 . - EGFR_HUMAN S 492 0.102 0.065 . - EGFR_HUMAN S 498 0.132 0.030 . - EGFR_HUMAN T 502 0.162 0.041 . - EGFR_HUMAN S 511 0.140 0.058 . - EGFR_HUMAN S 525 0.122 0.054 . - EGFR_HUMAN S 530 0.090 0.077 . - EGFR_HUMAN S 553 0.083 0.033 . - EGFR_HUMAN T 570 0.146 0.029 . - EGFR_HUMAN T 572 0.151 0.289 . - EGFR_HUMAN T 594 0.147 0.048 . - EGFR_HUMAN T 605 0.132 0.022 . - EGFR_HUMAN T 625 0.181 0.079 . - EGFR_HUMAN T 629 0.249 0.045 . - EGFR_HUMAN T 638 0.341 0.424 . - EGFR_HUMAN S 645 0.172 0.198 . - EGFR_HUMAN T 648 0.195 0.105 . - EGFR_HUMAN T 678 0.100 0.023 . - EGFR_HUMAN T 693 0.171 0.231 . - EGFR_HUMAN S 695 0.114 0.325 . - EGFR_HUMAN T 710 0.151 0.024 . - EGFR_HUMAN S 720 0.087 0.213 . - EGFR_HUMAN T 725 0.150 0.031 . - EGFR_HUMAN T 751 0.192 0.030 . - EGFR_HUMAN S 752 0.123 0.203 . - EGFR_HUMAN S 768 0.079 0.151 . - EGFR_HUMAN T 783 0.126 0.096 . - EGFR_HUMAN S 784 0.069 0.021 . - EGFR_HUMAN T 785 0.099 0.062 . - EGFR_HUMAN T 790 0.089 0.074 . - EGFR_HUMAN S 811 0.049 0.052 . - EGFR_HUMAN T 847 0.112 0.048 . - EGFR_HUMAN T 854 0.131 0.055 . - EGFR_HUMAN S 885 0.093 0.023 . - EGFR_HUMAN T 892 0.135 0.058 . - EGFR_HUMAN S 895 0.086 0.029 . - EGFR_HUMAN S 899 0.111 0.078 . - EGFR_HUMAN T 903 0.177 0.021 . - EGFR_HUMAN T 909 0.253 0.071 . - EGFR_HUMAN S 912 0.176 0.077 . - EGFR_HUMAN S 921 0.204 0.046 . - EGFR_HUMAN S 924 0.244 0.058 . - EGFR_HUMAN S 925 0.243 0.021 . - EGFR_HUMAN T 940 0.155 0.079 . - EGFR_HUMAN S 957 0.067 0.025 . - EGFR_HUMAN S 969 0.085 0.040 . - EGFR_HUMAN S 991 0.091 0.031 . - EGFR_HUMAN T 993 0.161 0.426 . - EGFR_HUMAN S 995 0.118 0.027 . - EGFR_HUMAN S 1025 0.240 0.056 . - EGFR_HUMAN S 1026 0.248 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1028 0.249 0.083 . - EGFR_HUMAN T 1029 0.332 0.202 . - EGFR_HUMAN S 1030 0.264 0.243 . - EGFR_HUMAN T 1032 0.436 0.049 . - EGFR_HUMAN S 1036 0.286 0.057 . - EGFR_HUMAN S 1037 0.282 0.104 . - EGFR_HUMAN S 1039 0.266 0.045 . - EGFR_HUMAN T 1041 0.333 0.053 . - EGFR_HUMAN S 1042 0.232 0.040 . - EGFR_HUMAN S 1045 0.184 0.017 . - EGFR_HUMAN T 1046 0.226 0.041 . - EGFR_HUMAN S 1057 0.102 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1064 0.135 0.018 . - EGFR_HUMAN S 1070 0.167 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1071 0.177 0.069 . - EGFR_HUMAN T 1074 0.295 0.123 . - EGFR_HUMAN T 1078 0.294 0.077 . - EGFR_HUMAN S 1081 0.187 0.020 . - EGFR_HUMAN T 1085 0.339 0.020 . - EGFR_HUMAN S 1096 0.229 0.033 . - EGFR_HUMAN S 1104 0.257 0.083 . - EGFR_HUMAN S 1120 0.255 0.370 . - EGFR_HUMAN S 1130 0.290 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1131 0.405 0.289 . - EGFR_HUMAN T 1141 0.360 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1145 0.305 0.048 . - EGFR_HUMAN S 1149 0.177 0.018 . - EGFR_HUMAN T 1150 0.258 0.071 . - EGFR_HUMAN S 1153 0.158 0.045 . - EGFR_HUMAN S 1162 0.132 0.034 . - EGFR_HUMAN S 1166 0.124 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1190 0.175 0.022 . - EGFR_HUMAN T 1191 0.272 0.030 . - EGFR_HUMAN S 1204 0.285 0.043 . - EGFR_HUMAN S 1205 0.306 0.066 . - -------------------------------------------------------------------------Download this log...
view log 1 month agoPASSED
Test began: 2012-01-01 00:01:49 Test ended: 2012-01-01 00:02:16 Result : Test passed ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... # waiting for job 82d18758a9ae191e067afd8867eecad9.... # job has finished Name: EGFR_HUMAN Length: 1210 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ------------------------------------------------------------------------ EGFR_HUMAN S 4 0.250 0.166 . - EGFR_HUMAN T 6 0.335 0.101 . - EGFR_HUMAN S 22 0.084 0.063 . - EGFR_HUMAN T 34 0.151 0.026 . - EGFR_HUMAN S 35 0.110 0.053 . - EGFR_HUMAN T 39 0.111 0.037 . - EGFR_HUMAN T 43 0.087 0.042 . - EGFR_HUMAN S 50 0.048 0.055 . - EGFR_HUMAN T 68 0.078 0.037 . - EGFR_HUMAN S 77 0.058 0.020 . - EGFR_HUMAN T 81 0.103 0.026 . - EGFR_HUMAN T 95 0.102 0.041 . - EGFR_HUMAN S 116 0.054 0.021 . - EGFR_HUMAN S 123 0.066 0.034 . - EGFR_HUMAN T 130 0.104 0.034 . - EGFR_HUMAN S 151 0.072 0.066 . - EGFR_HUMAN S 161 0.089 0.032 . - EGFR_HUMAN S 169 0.073 0.095 . - EGFR_HUMAN S 170 0.068 0.061 . - EGFR_HUMAN S 174 0.072 0.054 . - EGFR_HUMAN S 177 0.071 0.056 . - EGFR_HUMAN S 186 0.091 0.021 . - EGFR_HUMAN S 193 0.096 0.074 . - EGFR_HUMAN S 198 0.104 0.028 . - EGFR_HUMAN T 211 0.108 0.063 . - EGFR_HUMAN S 220 0.076 0.057 . - EGFR_HUMAN S 227 0.099 0.023 . - EGFR_HUMAN S 229 0.120 0.055 . - EGFR_HUMAN T 241 0.143 0.153 . - EGFR_HUMAN S 246 0.084 0.046 . - EGFR_HUMAN T 259 0.159 0.030 . - EGFR_HUMAN T 263 0.144 0.023 . - EGFR_HUMAN T 273 0.219 0.027 . - EGFR_HUMAN T 274 0.210 0.041 . - EGFR_HUMAN S 286 0.132 0.060 . - EGFR_HUMAN T 290 0.164 0.020 . - EGFR_HUMAN T 302 0.167 0.068 . - EGFR_HUMAN S 306 0.095 0.017 . - EGFR_HUMAN S 315 0.097 0.056 . - EGFR_HUMAN S 348 0.066 0.046 . - EGFR_HUMAN S 350 0.077 0.081 . - EGFR_HUMAN T 354 0.136 0.038 . - EGFR_HUMAN T 363 0.145 0.032 . - EGFR_HUMAN S 364 0.083 0.055 . - EGFR_HUMAN S 366 0.087 0.079 . - EGFR_HUMAN S 380 0.160 0.018 . - EGFR_HUMAN T 382 0.229 0.121 . - EGFR_HUMAN T 384 0.235 0.072 . - EGFR_HUMAN T 397 0.217 0.209 . - EGFR_HUMAN T 402 0.121 0.065 . - EGFR_HUMAN T 415 0.119 0.022 . - EGFR_HUMAN T 430 0.117 0.027 . - EGFR_HUMAN S 437 0.082 0.048 . - EGFR_HUMAN S 442 0.088 0.078 . - EGFR_HUMAN T 446 0.127 0.057 . - EGFR_HUMAN S 447 0.088 0.063 . - EGFR_HUMAN S 452 0.094 0.028 . - EGFR_HUMAN S 457 0.077 0.055 . - EGFR_HUMAN S 464 0.063 0.273 . - EGFR_HUMAN T 474 0.111 0.033 . - EGFR_HUMAN T 483 0.123 0.057 . - EGFR_HUMAN S 484 0.083 0.021 . - EGFR_HUMAN T 488 0.159 0.038 . - EGFR_HUMAN S 492 0.102 0.065 . - EGFR_HUMAN S 498 0.132 0.030 . - EGFR_HUMAN T 502 0.162 0.041 . - EGFR_HUMAN S 511 0.140 0.058 . - EGFR_HUMAN S 525 0.122 0.054 . - EGFR_HUMAN S 530 0.090 0.077 . - EGFR_HUMAN S 553 0.083 0.033 . - EGFR_HUMAN T 570 0.146 0.029 . - EGFR_HUMAN T 572 0.151 0.289 . - EGFR_HUMAN T 594 0.147 0.048 . - EGFR_HUMAN T 605 0.132 0.022 . - EGFR_HUMAN T 625 0.181 0.079 . - EGFR_HUMAN T 629 0.249 0.045 . - EGFR_HUMAN T 638 0.341 0.424 . - EGFR_HUMAN S 645 0.172 0.198 . - EGFR_HUMAN T 648 0.195 0.105 . - EGFR_HUMAN T 678 0.100 0.023 . - EGFR_HUMAN T 693 0.171 0.231 . - EGFR_HUMAN S 695 0.114 0.325 . - EGFR_HUMAN T 710 0.151 0.024 . - EGFR_HUMAN S 720 0.087 0.213 . - EGFR_HUMAN T 725 0.150 0.031 . - EGFR_HUMAN T 751 0.192 0.030 . - EGFR_HUMAN S 752 0.123 0.203 . - EGFR_HUMAN S 768 0.079 0.151 . - EGFR_HUMAN T 783 0.126 0.096 . - EGFR_HUMAN S 784 0.069 0.021 . - EGFR_HUMAN T 785 0.099 0.062 . - EGFR_HUMAN T 790 0.089 0.074 . - EGFR_HUMAN S 811 0.049 0.052 . - EGFR_HUMAN T 847 0.112 0.048 . - EGFR_HUMAN T 854 0.131 0.055 . - EGFR_HUMAN S 885 0.093 0.023 . - EGFR_HUMAN T 892 0.135 0.058 . - EGFR_HUMAN S 895 0.086 0.029 . - EGFR_HUMAN S 899 0.111 0.078 . - EGFR_HUMAN T 903 0.177 0.021 . - EGFR_HUMAN T 909 0.253 0.071 . - EGFR_HUMAN S 912 0.176 0.077 . - EGFR_HUMAN S 921 0.204 0.046 . - EGFR_HUMAN S 924 0.244 0.058 . - EGFR_HUMAN S 925 0.243 0.021 . - EGFR_HUMAN T 940 0.155 0.079 . - EGFR_HUMAN S 957 0.067 0.025 . - EGFR_HUMAN S 969 0.085 0.040 . - EGFR_HUMAN S 991 0.091 0.031 . - EGFR_HUMAN T 993 0.161 0.426 . - EGFR_HUMAN S 995 0.118 0.027 . - EGFR_HUMAN S 1025 0.240 0.056 . - EGFR_HUMAN S 1026 0.248 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1028 0.249 0.083 . - EGFR_HUMAN T 1029 0.332 0.202 . - EGFR_HUMAN S 1030 0.264 0.243 . - EGFR_HUMAN T 1032 0.436 0.049 . - EGFR_HUMAN S 1036 0.286 0.057 . - EGFR_HUMAN S 1037 0.282 0.104 . - EGFR_HUMAN S 1039 0.266 0.045 . - EGFR_HUMAN T 1041 0.333 0.053 . - EGFR_HUMAN S 1042 0.232 0.040 . - EGFR_HUMAN S 1045 0.184 0.017 . - EGFR_HUMAN T 1046 0.226 0.041 . - EGFR_HUMAN S 1057 0.102 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1064 0.135 0.018 . - EGFR_HUMAN S 1070 0.167 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1071 0.177 0.069 . - EGFR_HUMAN T 1074 0.295 0.123 . - EGFR_HUMAN T 1078 0.294 0.077 . - EGFR_HUMAN S 1081 0.187 0.020 . - EGFR_HUMAN T 1085 0.339 0.020 . - EGFR_HUMAN S 1096 0.229 0.033 . - EGFR_HUMAN S 1104 0.257 0.083 . - EGFR_HUMAN S 1120 0.255 0.370 . - EGFR_HUMAN S 1130 0.290 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1131 0.405 0.289 . - EGFR_HUMAN T 1141 0.360 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1145 0.305 0.048 . - EGFR_HUMAN S 1149 0.177 0.018 . - EGFR_HUMAN T 1150 0.258 0.071 . - EGFR_HUMAN S 1153 0.158 0.045 . - EGFR_HUMAN S 1162 0.132 0.034 . - EGFR_HUMAN S 1166 0.124 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1190 0.175 0.022 . - EGFR_HUMAN T 1191 0.272 0.030 . - EGFR_HUMAN S 1204 0.285 0.043 . - EGFR_HUMAN S 1205 0.306 0.066 . - -------------------------------------------------------------------------Download this log...
view log 2 months agoPASSED
Test began: 2011-12-17 15:55:57 Test ended: 2011-12-17 15:56:23 Result : Test passed ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... # waiting for job 9dc74a843424532929bc37cd937e6335.... # job has finished Name: EGFR_HUMAN Length: 1210 Name S/T Pos G-score I-score Y/N Comment ------------------------------------------------------------------------ EGFR_HUMAN S 4 0.250 0.166 . - EGFR_HUMAN T 6 0.335 0.101 . - EGFR_HUMAN S 22 0.084 0.063 . - EGFR_HUMAN T 34 0.151 0.026 . - EGFR_HUMAN S 35 0.110 0.053 . - EGFR_HUMAN T 39 0.111 0.037 . - EGFR_HUMAN T 43 0.087 0.042 . - EGFR_HUMAN S 50 0.048 0.055 . - EGFR_HUMAN T 68 0.078 0.037 . - EGFR_HUMAN S 77 0.058 0.020 . - EGFR_HUMAN T 81 0.103 0.026 . - EGFR_HUMAN T 95 0.102 0.041 . - EGFR_HUMAN S 116 0.054 0.021 . - EGFR_HUMAN S 123 0.066 0.034 . - EGFR_HUMAN T 130 0.104 0.034 . - EGFR_HUMAN S 151 0.072 0.066 . - EGFR_HUMAN S 161 0.089 0.032 . - EGFR_HUMAN S 169 0.073 0.095 . - EGFR_HUMAN S 170 0.068 0.061 . - EGFR_HUMAN S 174 0.072 0.054 . - EGFR_HUMAN S 177 0.071 0.056 . - EGFR_HUMAN S 186 0.091 0.021 . - EGFR_HUMAN S 193 0.096 0.074 . - EGFR_HUMAN S 198 0.104 0.028 . - EGFR_HUMAN T 211 0.108 0.063 . - EGFR_HUMAN S 220 0.076 0.057 . - EGFR_HUMAN S 227 0.099 0.023 . - EGFR_HUMAN S 229 0.120 0.055 . - EGFR_HUMAN T 241 0.143 0.153 . - EGFR_HUMAN S 246 0.084 0.046 . - EGFR_HUMAN T 259 0.159 0.030 . - EGFR_HUMAN T 263 0.144 0.023 . - EGFR_HUMAN T 273 0.219 0.027 . - EGFR_HUMAN T 274 0.210 0.041 . - EGFR_HUMAN S 286 0.132 0.060 . - EGFR_HUMAN T 290 0.164 0.020 . - EGFR_HUMAN T 302 0.167 0.068 . - EGFR_HUMAN S 306 0.095 0.017 . - EGFR_HUMAN S 315 0.097 0.056 . - EGFR_HUMAN S 348 0.066 0.046 . - EGFR_HUMAN S 350 0.077 0.081 . - EGFR_HUMAN T 354 0.136 0.038 . - EGFR_HUMAN T 363 0.145 0.032 . - EGFR_HUMAN S 364 0.083 0.055 . - EGFR_HUMAN S 366 0.087 0.079 . - EGFR_HUMAN S 380 0.160 0.018 . - EGFR_HUMAN T 382 0.229 0.121 . - EGFR_HUMAN T 384 0.235 0.072 . - EGFR_HUMAN T 397 0.217 0.209 . - EGFR_HUMAN T 402 0.121 0.065 . - EGFR_HUMAN T 415 0.119 0.022 . - EGFR_HUMAN T 430 0.117 0.027 . - EGFR_HUMAN S 437 0.082 0.048 . - EGFR_HUMAN S 442 0.088 0.078 . - EGFR_HUMAN T 446 0.127 0.057 . - EGFR_HUMAN S 447 0.088 0.063 . - EGFR_HUMAN S 452 0.094 0.028 . - EGFR_HUMAN S 457 0.077 0.055 . - EGFR_HUMAN S 464 0.063 0.273 . - EGFR_HUMAN T 474 0.111 0.033 . - EGFR_HUMAN T 483 0.123 0.057 . - EGFR_HUMAN S 484 0.083 0.021 . - EGFR_HUMAN T 488 0.159 0.038 . - EGFR_HUMAN S 492 0.102 0.065 . - EGFR_HUMAN S 498 0.132 0.030 . - EGFR_HUMAN T 502 0.162 0.041 . - EGFR_HUMAN S 511 0.140 0.058 . - EGFR_HUMAN S 525 0.122 0.054 . - EGFR_HUMAN S 530 0.090 0.077 . - EGFR_HUMAN S 553 0.083 0.033 . - EGFR_HUMAN T 570 0.146 0.029 . - EGFR_HUMAN T 572 0.151 0.289 . - EGFR_HUMAN T 594 0.147 0.048 . - EGFR_HUMAN T 605 0.132 0.022 . - EGFR_HUMAN T 625 0.181 0.079 . - EGFR_HUMAN T 629 0.249 0.045 . - EGFR_HUMAN T 638 0.341 0.424 . - EGFR_HUMAN S 645 0.172 0.198 . - EGFR_HUMAN T 648 0.195 0.105 . - EGFR_HUMAN T 678 0.100 0.023 . - EGFR_HUMAN T 693 0.171 0.231 . - EGFR_HUMAN S 695 0.114 0.325 . - EGFR_HUMAN T 710 0.151 0.024 . - EGFR_HUMAN S 720 0.087 0.213 . - EGFR_HUMAN T 725 0.150 0.031 . - EGFR_HUMAN T 751 0.192 0.030 . - EGFR_HUMAN S 752 0.123 0.203 . - EGFR_HUMAN S 768 0.079 0.151 . - EGFR_HUMAN T 783 0.126 0.096 . - EGFR_HUMAN S 784 0.069 0.021 . - EGFR_HUMAN T 785 0.099 0.062 . - EGFR_HUMAN T 790 0.089 0.074 . - EGFR_HUMAN S 811 0.049 0.052 . - EGFR_HUMAN T 847 0.112 0.048 . - EGFR_HUMAN T 854 0.131 0.055 . - EGFR_HUMAN S 885 0.093 0.023 . - EGFR_HUMAN T 892 0.135 0.058 . - EGFR_HUMAN S 895 0.086 0.029 . - EGFR_HUMAN S 899 0.111 0.078 . - EGFR_HUMAN T 903 0.177 0.021 . - EGFR_HUMAN T 909 0.253 0.071 . - EGFR_HUMAN S 912 0.176 0.077 . - EGFR_HUMAN S 921 0.204 0.046 . - EGFR_HUMAN S 924 0.244 0.058 . - EGFR_HUMAN S 925 0.243 0.021 . - EGFR_HUMAN T 940 0.155 0.079 . - EGFR_HUMAN S 957 0.067 0.025 . - EGFR_HUMAN S 969 0.085 0.040 . - EGFR_HUMAN S 991 0.091 0.031 . - EGFR_HUMAN T 993 0.161 0.426 . - EGFR_HUMAN S 995 0.118 0.027 . - EGFR_HUMAN S 1025 0.240 0.056 . - EGFR_HUMAN S 1026 0.248 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1028 0.249 0.083 . - EGFR_HUMAN T 1029 0.332 0.202 . - EGFR_HUMAN S 1030 0.264 0.243 . - EGFR_HUMAN T 1032 0.436 0.049 . - EGFR_HUMAN S 1036 0.286 0.057 . - EGFR_HUMAN S 1037 0.282 0.104 . - EGFR_HUMAN S 1039 0.266 0.045 . - EGFR_HUMAN T 1041 0.333 0.053 . - EGFR_HUMAN S 1042 0.232 0.040 . - EGFR_HUMAN S 1045 0.184 0.017 . - EGFR_HUMAN T 1046 0.226 0.041 . - EGFR_HUMAN S 1057 0.102 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1064 0.135 0.018 . - EGFR_HUMAN S 1070 0.167 0.055 . - EGFR_HUMAN S 1071 0.177 0.069 . - EGFR_HUMAN T 1074 0.295 0.123 . - EGFR_HUMAN T 1078 0.294 0.077 . - EGFR_HUMAN S 1081 0.187 0.020 . - EGFR_HUMAN T 1085 0.339 0.020 . - EGFR_HUMAN S 1096 0.229 0.033 . - EGFR_HUMAN S 1104 0.257 0.083 . - EGFR_HUMAN S 1120 0.255 0.370 . - EGFR_HUMAN S 1130 0.290 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1131 0.405 0.289 . - EGFR_HUMAN T 1141 0.360 0.053 . - EGFR_HUMAN T 1145 0.305 0.048 . - EGFR_HUMAN S 1149 0.177 0.018 . - EGFR_HUMAN T 1150 0.258 0.071 . - EGFR_HUMAN S 1153 0.158 0.045 . - EGFR_HUMAN S 1162 0.132 0.034 . - EGFR_HUMAN S 1166 0.124 0.052 . - EGFR_HUMAN S 1190 0.175 0.022 . - EGFR_HUMAN T 1191 0.272 0.030 . - EGFR_HUMAN S 1204 0.285 0.043 . - EGFR_HUMAN S 1205 0.306 0.066 . - -------------------------------------------------------------------------Download this log...
view log 2 months agoWARNING
Test began: 2011-12-14 20:36:23 Test ended: 2011-12-14 20:36:23 Result : Test warning ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... error obtaining jobidDownload this log...
view log 2 months agoWARNING
Test began: 2011-11-27 20:38:56 Test ended: 2011-11-27 20:38:57 Result : Test warning ------ stderr and stdout follow ------ # compiling runService ... # compiling pollQueue ... # compiling fetchResult ... error obtaining jobidDownload this log...
This test consists of the following files:
test_netoglyc.pl
#!/usr/bin/perl
# Description: This script runs the NetOGlyc 3.1d.ws0 Web Service. It requires no input; to be used for testing in the EMBRACE WS Registry.
# Author: Edita Bartaseviciute
# Email: edita@cbs.dtu.dk
# Version: 3.1d ws0
# Date: 2009-07-14
# usage: perl test_netoglyc.pl
# include standard XML::Compile helper functions (used to initiate WSDL proxys)
use strict;
require "xml-compile.pl"; # downloadable from the same site as this script
my $signalp = $ARGV[0];
# create proxy to NetOGlyc Web Service
my $netoglyc = WSDL2proxy ( 'http://www.cbs.dtu.dk/ws/NetOGlyc/NetOGlyc_3_1d_ws0.wsdl' );
# append schema definitions
$netoglyc = appendSchemas ( $netoglyc ,
"http://www.cbs.dtu.dk/ws/common/ws_common_1_0b.xsd" ,
"http://www.cbs.dtu.dk/ws/NetOGlyc/ws_netoglyc_3_1_ws0.xsd"
);
my %ops = addOperations ( $netoglyc ) ;
my @fasta;
my $entry = -1;
while (<DATA>) {
if (/^>(.*)/) {
my ($id , $comment) = split (" ",$1);
$entry++;
$fasta[$entry]->{id} = $id;
$fasta[$entry]->{comment} = $comment if defined $comment;
} elsif (/^([A-Za-z]+)/) {
$fasta[$entry]->{seq} .= $1;
}
}
my @sequence;
for ( my $i = 0 ; $i < scalar ( @fasta ) ; $i ++ ) {
push @sequence , { id => $fasta[$i]->{id} , comment => $fasta[$i]->{comment} , seq => $fasta[$i]->{seq} };
}
my $response;
if ($signalp) {
$response = $ops{runService}->(
parameters => {
parameters => {
signalp => 'required',
sequencedata => {sequence => [@sequence]} } });
}
else {
$response = $ops{runService}->(
parameters => {
parameters => {
sequencedata => {sequence => [@sequence]} } });
}
my $jobid;
if ( ! defined ( $response->{parameters}->{queueentry}) ) {
die "error obtaining jobid\n";
} else {
$jobid = $response->{parameters}->{queueentry}->{jobid};
print STDERR "# waiting for job $jobid";
my $status = "UNKNOWN";;
while ( $status =~ /ACTIVE|RUNNING|QUEUED|WAITING|PENDING|UNKNOWN/ ) {
my $response = $ops{pollQueue}->( job => { job => { jobid => $jobid } }) ;
$status = $response->{queueentry}->{queueentry}->{status};
print STDERR ".";
}
die "\nunexpected job status '$status'\n" unless $status eq "FINISHED";
print STDERR "\n# job has finished\n";
}
$response = $ops{fetchResult}->(job => { jobid => $jobid });
#printing the results (suitable for one sequence)
foreach my $ann (@{$response->{parameters}->{anndata}->{ann}}) {
my $sequence = $sequence[0]->{seq};
my $length = length ($sequence);
print "Name: $ann->{sequence}->{id}\t\tLength: $length\n\n";
print "Name\t\t\tS/T Pos G-score I-score Y/N Comment\n";
print "------------------------------------------------------------------------\n";
foreach my $annrecord (@{$ann->{annrecords}->{annrecord}}) {
my $G_score = sprintf ("%.3f", $annrecord->{score}[0]->{value});
my $I_score = sprintf ("%.3f", $annrecord->{score}[1]->{value});
my $pos = sprintf ("%4s", $annrecord->{pos});
my $S_T = substr ($sequence, $pos-1, 1);
my ($Y_N, $comment);
if (exists $annrecord->{comment}) {
$Y_N = substr ($annrecord->{comment}, 0, 1);
if ($annrecord->{comment} =~ m/signal/) {
$comment = substr ($annrecord->{comment}, 2);
}
else {
$comment = "-";
}
}
else {
$Y_N = ".";
$comment = "-";
}
print "$ann->{sequence}->{id}\t\t $S_T $pos $G_score $I_score $Y_N $comment\n";
}
print "-------------------------------------------------------------------------\n";
}
__DATA__
>EGFR_HUMAN P00533 EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR PRECURSOR (EC 2.7.1.112). - Homo sapiens (Human).
MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
GAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGI
CLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAA
RNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSY
GVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPK
FRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYLIPQ
QGFFSSPSTSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTED
SIDDTFLPVPEYINQSVPKRPAGSVQNPVYHNQPLNPAPSRDPHYQDPHSTAVGNPEYLN
TVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGSTAENAEYLRV
APQSSEFIGA
xml-compile.pl
#!/usr/bin/perl
# Description: Helper scripts used to initiate XML::Compile's proxys (WSDL+XSD)
# Author: Peter Fischer Hallin
# Email: pfh@cbs.dtu.dk
# Version: NA
# Date: 2008-02-13
use strict;
use XML::Compile;
use XML::Compile::WSDL11;
use XML::Compile::Transport::SOAPHTTP;
use MIME::Base64;
sub addOperations {
# builds a hash of all operations declared in the proxy
my ( $proxy , @OP ) = @_;
# @OP is an optional list of operations to compile. All will be compiled inless defined
my %ops;
my %inc;
if ( $#OP >= 0) {
foreach (@OP) {
$inc{$_} = 1;
}
}
foreach my $op ($proxy->operations) {
next if $#OP >= 0 and ! defined $inc{$op->{operation}};
print STDERR "# compiling $op->{operation} ... \n";
$ops{$op->{operation}} = $proxy->compileClient($op->{operation});
}
return %ops;
}
sub WSDL2proxy {
# loads a WSDL and returns its proxy
my $wsdl = XML::LibXML->new->parse_file($_[0]);
my $proxy = XML::Compile::WSDL11->new($wsdl);
return $proxy;
}
sub appendSchemas {
# you have to manually check which external schemas are included in
# your WSDL - this function will append them to the proxy for you
my ($proxy , @schemas) = @_;
foreach my $s (@schemas) {
my $f = XML::LibXML->new->parse_file($s);
$proxy->schemas->importDefinitions ($f);
}
return $proxy;
}
sub wait_job {
my ($op_handle,$jobid) = @_;
my $sleep = 0;
print STDERR "# polling job $jobid\n";
my $status = "UNKNOWN";
my $response;
while ( $status !~ /FINISHED|FAILED/ ) {
$response = $op_handle->( job => { job => { jobid => $jobid } }) ;
my $new_status = $response->{queueentry}->{queueentry}->{status};
if ( $new_status ne $status ) {
print STDERR "# job $jobid $new_status ($response->{queueentry}->{queueentry}->{datetime})\n";
$status = $new_status;
}
$sleep = 5 if $status eq "ACTIVE";
sleep $sleep;
}
die "# ERROR: job $jobid FAILED\n" if $status ne "FINISHED";
}
1;
»
- Login to post comments